RTMS تحریک مغناطیسی مغز است که در طی آن فعالیت الکتریکی مغز تحت تاثیر میدان مغناطیسی قرار میگیرد. میدان مغناطیسی از طریق جریان پالس هایی از سر عبور میکند در طی این روش میدان مغناطیسی میتواند نواحی خاصی از قشر مغز را تحریک میکند. هرپالس مغناطیسی به راحتی و بدون احساس درد از پوست سر و استخوان و پرده های مغزگذشته و به نورون های عصبی میرسد و موجب فعالیت کوتاه مدت نورون های عصبی آن قسمت از مغز میشود .
میدان مغناطیسی که در نتیجه RTMS ایجاد میشود علاوه بر ایمن بودن احساس ناخوشایندی نیز در فرد ایجاد نمیکند. عبور میدان مغناطیسی از مغز سبب ایجاد جریانی در سلول های عصبی مغز میشود و این سلول ها را تحریک میکند. RTMS میتواند برای هر بیمار به طور اختصاصی و در منطقه خاصی از مغز انجام بگیرد. این روش درمانی بسته به نوع بیماری و یا اختلال میتواند تاثیرات اختصاصی بازدارنده یا تحریکی برآن قسمت از مغز بگذارد این روش در بیمارانی که نسبت به درمان دارویی افسردگی پاسخ مثبت نداده اند به عنوان یک روش موثر کاربرد دارد
